职务犯罪侦查主要程序：
1、案件的受理；
2、初查和立案；
3、侦查；
4、审查逮捕。
经过以上几个阶段侦查终结，最终决定是否移送起诉。
根据《刑事诉讼法》第十八条第二款的规定：贪污贿赂犯罪，国家工作人员的渎职犯罪，国家机关工作人员利用职权实施的非法拘禁、刑讯逼供、报复陷害、非法搜查的侵犯公民人身权利的犯罪以及侵犯公民民主权利的犯罪，由人民检察院立案侦查。对于国家机关工作人员利用职权实施的其他重大的犯罪案件，需要由人民检察院直接受理的时候，经省级以上人民检察院决定，可以由人民检察院立案侦查。
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